約6年間活動を続けた日本消化器病学会の付置研究会「消化管運動研究会」を継承する形で、平成10年7月、日本消化器病学会の関連研究会として設立された。 消化管運動を中心とした基礎的及び臨床的研究の振興を目的として、日本国内外の知識の交流を図ると同時に、人類の健康の増進及び福祉の増大に寄与する事を目指す。平成11年度より、本格的に活動を開始した。 年1回、日本国内にて学術集会(研究会)を開催している(原則として、内科系・外科系交互に会長を務める)。